Abstract
Reduced glomerular filtration rate defines chronic kidney disease and is associated with cardiovascular and all-cause mortality. We conducted a meta-analysis of genome-wide association studies for estimated glomerular filtration rate (eGFR), combining data across 133,413 individuals with replication in up to 42,166 individuals. We identify 24 new and confirm 29 previously identified loci. Of these 53 loci, 19 associate with eGFR among individuals with diabetes. Using bioinformatics, we show that identified genes at eGFR loci are enriched for expression in kidney tissues and in pathways relevant for kidney development and transmembrane transporter activity, kidney structure, and regulation of glucose metabolism. Chromatin state mapping and DNase I hypersensitivity analyses across adult tissues demonstrate preferential mapping of associated variants to regulatory regions in kidney but not extra-renal tissues. These findings suggest that genetic determinants of eGFR are mediated largely through direct effects within the kidney and highlight important cell types and biological pathways.
| Original language | English |
|---|---|
| Article number | 10023 |
| Journal | Nature Communications |
| Volume | 7 |
| DOIs | |
| State | Published - Jan 21 2016 |
Bibliographical note
Funding Information:168Center for Statistical Genetics, Department of Biostatistics, University of Michigan, School of Public Health, Ann Arbor, Michigan 48103, USA. 169Department of Nutrition, University of North Carolina, Chapel Hill, North Carolina 27599, USA. 170Department of Public Health and Primary Care, University of Cambridge, Cambridge, CB1 8RN, UK. 171Department of Medicine, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts 02115, USA. 172Department of Genetics, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts 02115, USA. 173Center for Complex Disease Genomics, McKusick-Nathans Institute of Genetic Medicine, Johns Hopkins University School of Medicine, Baltimore, Maryland 21205, USA. 174Center for Human Genetic Research, Cardiovascular Research Center, Massachusetts General Hospital, Boston, Massachusetts 02114, USA. 175Geriatric Rehabilitation Unit, Azienda Sanitaria Firenze (ASF), 50125 Florence, Italy. 176Département de Génétique Médicale, Université de Lausanne, Lausanne 1015, Switzerland. 177Pathology and Laboratory Medicine, University of Western Australia, 6009 Crawley, Western Australia, Australia. 178Department of Physiology and Biophysics, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, California 90033, USA. 179Cardiovascular Health Research Unit, Department of Medicine, University of Washington, Seattle 98195, Washington, USA. 180National Human Genome Research Institute, National Institutes of Health, Bethesda, Maryland 20892, USA. 181Department of Medicine III, Medical Faculty Carl Gustav Carus at the Technical University of Dresden, Dresden 01307, Germany. 182Julius Center for Health Sciences and Primary Care, University Medical Center Utrecht, Heidelberglaan 100, Utrecht 3508 GA, The Netherlands. 183Leibniz-Institute for Arteriosclerosis Research, Department of Molecular Genetics of Cardiovascular Disease, University of Münster, Münster, Germany. 184University Hospital Münster, Internal Medicine D, Münster, Germany. 185Department of Cardiovascular Sciences, University of Leicester, Glenfield Hospital, Leicester LE3 9QP, UK. 186Clinical Pharmacology Unit, University of Cambridge, Addenbrookes Hospital, Hills Road, Cambridge CB2 2QQ, UK. 187Department of Health Sciences, University of Leicester, University Rd, Leicester LE1 7RH, UK. 188Faculty of Epidemiology and Population Health, London School of Hygiene and Tropical Medicine, London WC1E 7HT, UK. 189Clinical Pharmacology and The Genome Centre, William Harvey Research Institute, Barts and The London School of Medicine and Dentistry, Queen Mary University of London, London EC1M 6BQ, UK. 190Department of Epidemiology and Biostatistics, School of Public Health, Imperial College London, Norfolk Place, London W2 1PG, UK. 191Centre for Cellular and Molecular Biology (CCMB), Council of Scientific and Industrial Research (CSIR), Uppal Road, Hyderabad 500 007, India. 192University of Maryland, School of Medicine, Baltimore, Maryland 21201, USA.
Funding Information:
Study-specific acknowledgements and funding sources for participating studies are reported in Supplementary Note. Zebrafish work was supported by NIH R01DK090311 and R24OD017870 to W.G.
Publisher Copyright:
© 2016, Nature Publishing Group. All rights reserved.
ASJC Scopus subject areas
- Chemistry (all)
- Biochemistry, Genetics and Molecular Biology (all)
- General
- Physics and Astronomy (all)
Access to Document
Other files and links
Fingerprint
Dive into the research topics of 'Genetic associations at 53 loci highlight cell types and biological pathways relevant for kidney function'. Together they form a unique fingerprint.Cite this
- APA
- Author
- BIBTEX
- Harvard
- Standard
- RIS
- Vancouver
}
Genetic associations at 53 loci highlight cell types and biological pathways relevant for kidney function. / Pattaro, Cristian; Teumer, Alexander; Gorski, Mathias et al.
In: Nature Communications, Vol. 7, 10023, 21.01.2016.Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
TY - JOUR
T1 - Genetic associations at 53 loci highlight cell types and biological pathways relevant for kidney function
AU - Pattaro, Cristian
AU - Teumer, Alexander
AU - Gorski, Mathias
AU - Chu, Audrey Y.
AU - Li, Man
AU - Mijatovic, Vladan
AU - Garnaas, Maija
AU - Tin, Adrienne
AU - Sorice, Rossella
AU - Li, Yong
AU - Taliun, Daniel
AU - Olden, Matthias
AU - Foster, Meredith
AU - Yang, Qiong
AU - Chen, Ming Huei
AU - Pers, Tune H.
AU - Johnson, Andrew D.
AU - Ko, Yi An
AU - Fuchsberger, Christian
AU - Tayo, Bamidele
AU - Nalls, Michael
AU - Feitosa, Mary F.
AU - Isaacs, Aaron
AU - Dehghan, Abbas
AU - D'Adamo, Pio
AU - Adeyemo, Adebowale
AU - Dieffenbach, Aida Karina
AU - Zonderman, Alan B.
AU - Nolte, Ilja M.
AU - Van Der Most, Peter J.
AU - Wright, Alan F.
AU - Shuldiner, Alan R.
AU - Morrison, Alanna C.
AU - Hofman, Albert
AU - Smith, Albert V.
AU - Dreisbach, Albert W.
AU - Franke, Andre
AU - Uitterlinden, Andre G.
AU - Metspalu, Andres
AU - Tonjes, Anke
AU - Lupo, Antonio
AU - Robino, Antonietta
AU - Johansson, Åsa
AU - Demirkan, Ayse
AU - Kollerits, Barbara
AU - Freedman, Barry I.
AU - Ponte, Belen
AU - Oostra, Ben A.
AU - Paulweber, Bernhard
AU - Krämer, Bernhard K.
AU - Mitchell, Braxton D.
AU - Buckley, Brendan M.
AU - Peralta, Carmen A.
AU - Hayward, Caroline
AU - Helmer, Catherine
AU - Rotimi, Charles N.
AU - Shaffer, Christian M.
AU - Müller, Christian
AU - Sala, Cinzia
AU - Van Duijn, Cornelia M.
AU - Saint-Pierre, Aude
AU - Ackermann, Daniel
AU - Shriner, Daniel
AU - Ruggiero, Daniela
AU - Toniolo, Daniela
AU - Lu, Yingchang
AU - Cusi, Daniele
AU - Czamara, Darina
AU - Ellinghaus, David
AU - Siscovick, David S.
AU - Ruderfer, Douglas
AU - Gieger, Christian
AU - Grallert, Harald
AU - Rochtchina, Elena
AU - Atkinson, Elizabeth J.
AU - Holliday, Elizabeth G.
AU - Boerwinkle, Eric
AU - Salvi, Erika
AU - Bottinger, Erwin P.
AU - Murgia, Federico
AU - Rivadeneira, Fernando
AU - Ernst, Florian
AU - Kronenberg, Florian
AU - Hu, Frank B.
AU - Navis, Gerjan J.
AU - Curhan, Gary C.
AU - Ehret, George B.
AU - Homuth, Georg
AU - Coassin, Stefan
AU - Thun, Gian Andri
AU - Pistis, Giorgio
AU - Gambaro, Giovanni
AU - Malerba, Giovanni
AU - Montgomery, Grant W.
AU - Eiriksdottir, Gudny
AU - Jacobs, Gunnar
AU - Li, Guo
AU - Wichmann, H. Erich
AU - Campbell, Harry
AU - Schmidt, Helena
AU - Wallaschofski, Henri
AU - Völzke, Henry
AU - Brenner, Hermann
AU - Kroemer, Heyo K.
AU - Kramer, Holly
AU - Lin, Honghuang
AU - Leach, I. Mateo
AU - Ford, Ian
AU - Guessous, Idris
AU - Rudan, Igor
AU - Prokopenko, Inga
AU - Borecki, Ingrid
AU - Heid, Iris M.
AU - Kolcic, Ivana
AU - Persico, Ivana
AU - Jukema, J. Wouter
AU - Wilson, James F.
AU - Felix, Janine F.
AU - Divers, Jasmin
AU - Lambert, Jean Charles
AU - Stafford, Jeanette M.
AU - Gaspoz, Jean Michel
AU - Smith, Jennifer A.
AU - Faul, Jessica D.
AU - Wang, Jie Jin
AU - Ding, Jingzhong
AU - Hirschhorn, Joel N.
AU - Attia, John
AU - Whitfield, John B.
AU - Chalmers, John
AU - Viikari, Jorma
AU - Coresh, Josef
AU - Denny, Joshua C.
AU - Karjalainen, Juha
AU - Fernandes, Jyotika K.
AU - Endlich, Karlhans
AU - Butterbach, Katja
AU - Keene, Keith L.
AU - Lohman, Kurt
AU - Portas, Laura
AU - Launer, Lenore J.
AU - Lyytikäinen, Leo Pekka
AU - Yengo, Loic
AU - Franke, Lude
AU - Ferrucci, Luigi
AU - Rose, Lynda M.
AU - Kedenko, Lyudmyla
AU - Rao, Madhumathi
AU - Struchalin, Maksim
AU - Kleber, Marcus E.
AU - Cavalieri, Margherita
AU - Haun, Margot
AU - Cornelis, Marilyn C.
AU - Ciullo, Marina
AU - Pirastu, Mario
AU - De Andrade, Mariza
AU - McEvoy, Mark A.
AU - Woodward, Mark
AU - Adam, Martin
AU - Cocca, Massimiliano
AU - Nauck, Matthias
AU - Imboden, Medea
AU - Waldenberger, Melanie
AU - Pruijm, Menno
AU - Metzger, Marie
AU - Stumvoll, Michael
AU - Evans, Michele K.
AU - Sale, Michele M.
AU - Kähönen, Mika
AU - Boban, Mladen
AU - Bochud, Murielle
AU - Rheinberger, Myriam
AU - Verweij, Niek
AU - Bouatia-Naji, Nabila
AU - Martin, Nicholas G.
AU - Hastie, Nick
AU - Probst-Hensch, Nicole
AU - Soranzo, Nicole
AU - Devuyst, Olivier
AU - Raitakari, Olli
AU - Gottesman, Omri
AU - Franco, Oscar H.
AU - Polasek, Ozren
AU - Gasparini, Paolo
AU - Munroe, Patricia B.
AU - Ridker, Paul M.
AU - Mitchell, Paul
AU - Muntner, Paul
AU - Meisinger, Christa
AU - Smit, Johannes H.
AU - Abecasis, Goncalo R.
AU - Adair, Linda S.
AU - Alexander, Myriam
AU - Altshuler, David
AU - Amin, Najaf
AU - Arking, Dan E.
AU - Arora, Pankaj
AU - Aulchenko, Yurii
AU - Bakker, Stephan J.L.
AU - Bandinelli, Stefania
AU - Barroso, Ines
AU - Beckmann, Jacques S.
AU - Beilby, John P.
AU - Bergman, Richard N.
AU - Bergmann, Sven
AU - Bis, Joshua C.
AU - Boehnke, Michael
AU - Bonnycastle, Lori L.
AU - Bornstein, Stefan R.
AU - Bots, Michiel L.
AU - Bragg-Gresham, Jennifer L.
AU - Brand, Stefan Martin
AU - Brand, Eva
AU - Braund, Peter S.
AU - Brown, Morris J.
AU - Burton, Paul R.
AU - Casas, Juan P.
AU - Caulfield, Mark J.
AU - Chakravarti, Aravinda
AU - Chambers, John C.
AU - Chandak, Giriraj R.
AU - Chang, Yen Pei C.
AU - Charchar, Fadi J.
AU - Chaturvedi, Nish
AU - Cho, Yoon Shin
AU - Clarke, Robert
AU - Collins, Francis S.
AU - Collins, Rory
AU - Connell, John M.
AU - Cooper, Jackie A.
AU - Cooper, Matthew N.
AU - Cooper, Richard S.
AU - Corsi, Anna Maria
AU - Dörr, Marcus
AU - Dahgam, Santosh
AU - Danesh, John
AU - Smith, George Davey
AU - Day, Ian N.M.
AU - Deloukas, Panos
AU - Denniff, Matthew
AU - Dominiczak, Anna F.
AU - Dong, Yanbin
AU - Doumatey, Ayo
AU - Elliott, Paul
AU - Elosua, Roberto
AU - Erdmann, Jeanette
AU - Eyheramendy, Susana
AU - Farrall, Martin
AU - Fava, Cristiano
AU - Forrester, Terrence
AU - Fowkes, F. Gerald R.
AU - Fox, Ervin R.
AU - Frayling, Timothy M.
AU - Galan, Pilar
AU - Ganesh, Santhi K.
AU - Garcia, Melissa
AU - Gaunt, Tom R.
AU - Glazer, Nicole L.
AU - Go, Min Jin
AU - Goel, Anuj
AU - Grässler, Jürgen
AU - Grobbee, Diederick E.
AU - Groop, Leif
AU - Guarrera, Simonetta
AU - Guo, Xiuqing
AU - Hadley, David
AU - Hamsten, Anders
AU - Han, Bok Ghee
AU - Hardy, Rebecca
AU - Hartikainen, Anna Liisa
AU - Heath, Simon
AU - Heckbert, Susan R.
AU - Hedblad, Bo
AU - Hercberg, Serge
AU - Hernandez, Dena
AU - Hicks, Andrew A.
AU - Hilton, Gina
AU - Hingorani, Aroon D.
AU - Hoffman Bolton, Judith A.
AU - Hopewell, Jemma C.
AU - Howard, Philip
AU - Humphries, Steve E.
AU - Hunt, Steven C.
AU - Hveem, Kristian
AU - Ikram, M. Arfan
AU - Islam, Muhammad
AU - Iwai, Naoharu
AU - Jarvelin, Marjo Riitta
AU - Jackson, Anne U.
AU - Jafar, Tazeen H.
AU - Janipalli, Charles S.
AU - Johnson, Toby
AU - Kathiresan, Sekar
AU - Khaw, Kay Tee
AU - Kim, Hyung Lae
AU - Kinra, Sanjay
AU - Kita, Yoshikuni
AU - Kivimaki, Mika
AU - Kooner, Jaspal S.
AU - Kumar, M. J.Kranthi
AU - Kuh, Diana
AU - Kulkarni, Smita R.
AU - Kumari, Meena
AU - Kuusisto, Johanna
AU - Kuznetsova, Tatiana
AU - Laakso, Markku
AU - Laan, Maris
AU - Laitinen, Jaana
AU - Lakatta, Edward G.
AU - Langefeld, Carl D.
AU - Larson, Martin G.
AU - Lathrop, Mark
AU - Lawlor, Debbie A.
AU - Lawrence, Robert W.
AU - Lee, Jong Young
AU - Lee, Nanette R.
AU - Levy, Daniel
AU - Li, Yali
AU - Longstreth, Will T.
AU - Luan, Jian'an
AU - Lucas, Gavin
AU - Ludwig, Barbara
AU - Mangino, Massimo
AU - Mani, K. Radha
AU - Marmot, Michael G.
AU - Mattace-Raso, Francesco U.S.
AU - Matullo, Giuseppe
AU - McArdle, Wendy L.
AU - McKenzie, Colin A.
AU - Meitinger, Thomas
AU - Melander, Olle
AU - Meneton, Pierre
AU - Meschia, James F.
AU - Miki, Tetsuro
AU - Milaneschi, Yuri
AU - Mohlke, Karen L.
AU - Mooser, Vincent
AU - Morken, Mario A.
AU - Morris, Richard W.
AU - Mosley, Thomas H.
AU - Najjar, Samer
AU - Narisu, Narisu
AU - Newton-Cheh, Christopher
AU - Nguyen, Khanh Dung Hoang
AU - Nilsson, Peter
AU - Nyberg, Fredrik
AU - O'Donnell, Christopher J.
AU - Ogihara, Toshio
AU - Ohkubo, Takayoshi
AU - Okamura, Tomonori
AU - Ong, Rick Twee Hee
AU - Ongen, Halit
AU - Onland-Moret, N. Charlotte
AU - O'Reilly, Paul F.
AU - Org, Elin
AU - Orru, Marco
AU - Palmas, Walter
AU - Palmen, Jutta
AU - Palmer, Lyle J.
AU - Palmer, Nicholette D.
AU - Parker, Alex N.
AU - Peden, John F.
AU - Peltonen, Leena
AU - Perola, Markus
AU - Pihur, Vasyl
AU - Platou, Carl G.P.
AU - Plump, Andrew
AU - Prabhakaran, Dorairajan
AU - Psaty, Bruce M.
AU - Raffel, Leslie J.
AU - Rao, Dabeeru C.
AU - Rasheed, Asif
AU - Ricceri, Fulvio
AU - Rice, Kenneth M.
AU - Rosengren, Annika
AU - Rotter, Jerome I.
AU - Rudock, Megan E.
AU - Sõber, Siim
AU - Salako, Tunde
AU - Saleheen, Danish
AU - Salomaa, Veikko
AU - Samani, Nilesh J.
AU - Schwartz, Steven M.
AU - Schwarz, Peter E.H.
AU - Scott, Laura J.
AU - Scott, James
AU - Scuteri, Angelo
AU - Sehmi, Joban S.
AU - Seielstad, Mark
AU - Seshadri, Sudha
AU - Sharma, Pankaj
AU - Shaw-Hawkins, Sue
AU - Shi, Gang
AU - Shrine, Nick R.G.
AU - Sijbrands, Eric J.G.
AU - Sim, Xueling
AU - Singleton, Andrew
AU - Sjögren, Marketa
AU - Smith, Nicholas L.
AU - Artigas, Maria Soler
AU - Spector, Tim D.
AU - Staessen, Jan A.
AU - Stancakova, Alena
AU - Steinle, Nanette I.
AU - Strachan, David P.
AU - Stringham, Heather M.
AU - Sun, Yan V.
AU - Swift, Amy J.
AU - Tabara, Yasuharu
AU - Tai, E. Shyong
AU - Talmud, Philippa J.
AU - Taylor, Andrew
AU - Terzic, Janos
AU - Thelle, Dag S.
AU - Tobin, Martin D.
AU - Tomaszewski, Maciej
AU - Tripathy, Vikal
AU - Tuomilehto, Jaakko
AU - Tzoulaki, Ioanna
AU - Uda, Manuela
AU - Ueshima, Hirotsugu
AU - Uiterwaal, Cuno S.P.M.
AU - Umemura, Satoshi
AU - Van Der Harst, Pim
AU - Van Der Schouw, Yvonne T.
AU - Van Gilst, Wiek H.
AU - Vartiainen, Erkki
AU - Vasan, Ramachandran S.
AU - Veldre, Gudrun
AU - Verwoert, Germaine C.
AU - Viigimaa, Margus
AU - Vinay, D. G.
AU - Vineis, Paolo
AU - Voight, Benjamin F.
AU - Vollenweider, Peter
AU - Wagenknecht, Lynne E.
AU - Wain, Louise V.
AU - Wang, Xiaoling
AU - Wang, Thomas J.
AU - Wareham, Nicholas J.
AU - Watkins, Hugh
AU - Weder, Alan B.
AU - Whincup, Peter H.
AU - Wiggins, Kerri L.
AU - Witteman, Jacqueline C.M.
AU - Wong, Andrew
AU - Wu, Ying
AU - Yajnik, Chittaranjan S.
AU - Yao, Jie
AU - Young, J. H.
AU - Zelenika, Diana
AU - Zhai, Guangju
AU - Zhang, Weihua
AU - Zhang, Feng
AU - Zhao, Jing Hua
AU - Zhu, Haidong
AU - Zhu, Xiaofeng
AU - Zitting, Paavo
AU - Zukowska-Szczechowska, Ewa
AU - Okada, Yukinori
AU - Wu, Jer Yuarn
AU - Gu, Dongfeng
AU - Takeuchi, Fumihiko
AU - Takahashi, Atsushi
AU - Maeda, Shiro
AU - Tsunoda, Tatsuhiko
AU - Chen, Peng
AU - Lim, Su Chi
AU - Wong, Tien Yin
AU - Liu, Jianjun
AU - Young, Terri L.
AU - Aung, Tin
AU - Teo, Yik Ying
AU - Kim, Young Jin
AU - Kang, Daehee
AU - Chen, Chien Hsiun
AU - Tsai, Fuu Jen
AU - Chang, Li Ching
AU - Fann, S. J.Cathy
AU - Mei, Hao
AU - Hixson, James E.
AU - Chen, Shufeng
AU - Katsuya, Tomohiro
AU - Isono, Masato
AU - Albrecht, Eva
AU - Yamamoto, Kazuhiko
AU - Kubo, Michiaki
AU - Nakamura, Yusuke
AU - Kamatani, Naoyuki
AU - Kato, Norihiro
AU - He, Jiang
AU - Chen, Yuan Tsong
AU - Tanaka, Toshihiro
AU - Reilly, Muredach P.
AU - Schunkert, Heribert
AU - Assimes, Themistocles L.
AU - Hall, Alistair
AU - Hengstenberg, Christian
AU - König, Inke R.
AU - Laaksonen, Reijo
AU - McPherson, Ruth
AU - Thompson, John R.
AU - Thorsteinsdottir, Unnur
AU - Ziegler, Andreas
AU - Absher, Devin
AU - Chen, Li
AU - Cupples, L. Adrienne
AU - Halperin, Eran
AU - Li, Mingyao
AU - Musunuru, Kiran
AU - Preuss, Michael
AU - Schillert, Arne
AU - Thorleifsson, Gudmar
AU - Wells, George A.
AU - Holm, Hilma
AU - Roberts, Robert
AU - Stewart, Alexandre F.R.
AU - Fortmann, Stephen
AU - Go, Alan
AU - Hlatky, Mark
AU - Iribarren, Carlos
AU - Knowles, Joshua
AU - Myers, Richard
AU - Quertermous, Thomas
AU - Sidney, Steven
AU - Risch, Neil
AU - Tang, Hua
AU - Blankenberg, Stefan
AU - Schnabel, Renate
AU - Sinning, Christoph
AU - Lackner, Karl J.
AU - Tiret, Laurence
AU - Nicaud, Viviane
AU - Cambien, Francois
AU - Bickel, Christoph
AU - Rupprecht, Hans J.
AU - Perret, Claire
AU - Proust, Carole
AU - Münzel, Thomas F.
AU - Barbalic, Maja
AU - Chen, Ida Yii Der
AU - Demissie-Banjaw, Serkalem
AU - Folsom, Aaron
AU - Lumley, Thomas
AU - Marciante, Kristin
AU - Taylor, Kent D.
AU - Volcik, Kelly
AU - Gretarsdottir, Solveig
AU - Gulcher, Jeffrey R.
AU - Kong, Augustine
AU - Stefansson, Kari
AU - Thorgeirsson, Gudmundur
AU - Andersen, Karl
AU - Fischer, Marcus
AU - Grosshennig, Anika
AU - Linsel-Nitschke, Patrick
AU - Stark, Klaus
AU - Schreiber, Stefan
AU - Aherrahrou, Zouhair
AU - Bruse, Petra
AU - Doering, Angela
AU - Klopp, Norman
AU - Diemert, Patrick
AU - Loley, Christina
AU - Medack, Anja
AU - Nahrstedt, Janja
AU - Peters, Annette
AU - Wagner, Arnika K.
AU - Willenborg, Christina
AU - Böhm, Bernhard O.
AU - Dobnig, Harald
AU - Grammer, Tanja B.
AU - Hoffmann, Michael M.
AU - Meinitzer, Andreas
AU - Winkelmann, Bernhard R.
AU - Pilz, Stefan
AU - Renner, Wilfried
AU - Scharnagl, Hubert
AU - Stojakovic, Tatjana
AU - Tomaschitz, Andreas
AU - Winkler, Karl
AU - Guiducci, Candace
AU - Burtt, Noel
AU - Gabriel, Stacey B.
AU - Dandona, Sonny
AU - Jarinova, Olga
AU - Qu, Liming
AU - Wilensky, Robert
AU - Matthai, William
AU - Hakonarson, Hakon H.
AU - Devaney, Joe
AU - Burnett, Mary Susan
AU - Pichard, Augusto D.
AU - Kent, Kenneth M.
AU - Satler, Lowell
AU - Lindsay, Joseph M.
AU - Waksman, Ron
AU - Knouff, Christopher W.
AU - Waterworth, Dawn M.
AU - Walker, Max C.
AU - Epstein, Stephen E.
AU - Rader, Daniel J.
AU - Nelson, Christopher P.
AU - Wright, Benjamin J.
AU - Balmforth, Anthony J.
AU - Ball, Stephen G.
AU - Loehr, Laura R.
AU - Rosamond, Wayne D.
AU - Benjamin, Emelia
AU - Haritunians, Talin
AU - Couper, David
AU - Murabito, Joanne
AU - Wang, Ying A.
AU - Stricker, Bruno H.
AU - Chang, Patricia P.
AU - Willerson, James T.
AU - Felix, Stephan B.
AU - Watzinger, Norbert
AU - Aragam, Jayashri
AU - Zweiker, Robert
AU - Lind, Lars
AU - Rodeheffer, Richard J.
AU - Greiser, Karin Halina
AU - Deckers, Jaap W.
AU - Stritzke, Jan
AU - Ingelsson, Erik
AU - Kullo, Iftikhar
AU - Haerting, Johannes
AU - Reffelmann, Thorsten
AU - Redfield, Margaret M.
AU - Werdan, Karl
AU - Mitchell, Gary F.
AU - Arnett, Donna K.
AU - Gottdiener, John S.
AU - Blettner, Maria
AU - Friedrich, Nele
AU - Kovacs, Peter
AU - Wild, Philipp S.
AU - Froguel, Philippe
AU - Rettig, Rainer
AU - Mägi, Reedik
AU - Biffar, Reiner
AU - Schmidt, Reinhold
AU - Middelberg, Rita P.S.
AU - Carroll, Robert J.
AU - Penninx, Brenda W.
AU - Scott, Rodney J.
AU - Katz, Ronit
AU - Sedaghat, Sanaz
AU - Wild, Sarah H.
AU - Kardia, Sharon L.R.
AU - Ulivi, Sheila
AU - Hwang, Shih Jen
AU - Enroth, Stefan
AU - Kloiber, Stefan
AU - Trompet, Stella
AU - Stengel, Benedicte
AU - Hancock, Stephen J.
AU - Turner, Stephen T.
AU - Rosas, Sylvia E.
AU - Stracke, Sylvia
AU - Harris, Tamara B.
AU - Zeller, Tanja
AU - Zemunik, Tatijana
AU - Lehtimäki, Terho
AU - Illig, Thomas
AU - Aspelund, Thor
AU - Nikopensius, Tiit
AU - Esko, Tonu
AU - Tanaka, Toshiko
AU - Gyllensten, Ulf
AU - Völker, Uwe
AU - Emilsson, Valur
AU - Vitart, Veronique
AU - Aalto, Ville
AU - Gudnason, Vilmundur
AU - Chouraki, Vincent
AU - Chen, Wei Min
AU - Igl, Wilmar
AU - März, Winfried
AU - Koenig, Wolfgang
AU - Lieb, Wolfgang
AU - Loos, Ruth J.F.
AU - Liu, Yongmei
AU - Snieder, Harold
AU - Pramstaller, Peter P.
AU - Parsa, Afshin
AU - O'Connell, Jeffrey R.
AU - Susztak, Katalin
AU - Hamet, Pavel
AU - Tremblay, Johanne
AU - De Boer, Ian H.
AU - Böger, Carsten A.
AU - Goessling, Wolfram
AU - Chasman, Daniel I.
AU - Köttgen, Anna
AU - Kao, W. H.Linda
AU - Fox, Caroline S.
N1 - Funding Information: 168Center for Statistical Genetics, Department of Biostatistics, University of Michigan, School of Public Health, Ann Arbor, Michigan 48103, USA. 169Department of Nutrition, University of North Carolina, Chapel Hill, North Carolina 27599, USA. 170Department of Public Health and Primary Care, University of Cambridge, Cambridge, CB1 8RN, UK. 171Department of Medicine, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts 02115, USA. 172Department of Genetics, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts 02115, USA. 173Center for Complex Disease Genomics, McKusick-Nathans Institute of Genetic Medicine, Johns Hopkins University School of Medicine, Baltimore, Maryland 21205, USA. 174Center for Human Genetic Research, Cardiovascular Research Center, Massachusetts General Hospital, Boston, Massachusetts 02114, USA. 175Geriatric Rehabilitation Unit, Azienda Sanitaria Firenze (ASF), 50125 Florence, Italy. 176Département de Génétique Médicale, Université de Lausanne, Lausanne 1015, Switzerland. 177Pathology and Laboratory Medicine, University of Western Australia, 6009 Crawley, Western Australia, Australia. 178Department of Physiology and Biophysics, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, California 90033, USA. 179Cardiovascular Health Research Unit, Department of Medicine, University of Washington, Seattle 98195, Washington, USA. 180National Human Genome Research Institute, National Institutes of Health, Bethesda, Maryland 20892, USA. 181Department of Medicine III, Medical Faculty Carl Gustav Carus at the Technical University of Dresden, Dresden 01307, Germany. 182Julius Center for Health Sciences and Primary Care, University Medical Center Utrecht, Heidelberglaan 100, Utrecht 3508 GA, The Netherlands. 183Leibniz-Institute for Arteriosclerosis Research, Department of Molecular Genetics of Cardiovascular Disease, University of Münster, Münster, Germany. 184University Hospital Münster, Internal Medicine D, Münster, Germany. 185Department of Cardiovascular Sciences, University of Leicester, Glenfield Hospital, Leicester LE3 9QP, UK. 186Clinical Pharmacology Unit, University of Cambridge, Addenbrookes Hospital, Hills Road, Cambridge CB2 2QQ, UK. 187Department of Health Sciences, University of Leicester, University Rd, Leicester LE1 7RH, UK. 188Faculty of Epidemiology and Population Health, London School of Hygiene and Tropical Medicine, London WC1E 7HT, UK. 189Clinical Pharmacology and The Genome Centre, William Harvey Research Institute, Barts and The London School of Medicine and Dentistry, Queen Mary University of London, London EC1M 6BQ, UK. 190Department of Epidemiology and Biostatistics, School of Public Health, Imperial College London, Norfolk Place, London W2 1PG, UK. 191Centre for Cellular and Molecular Biology (CCMB), Council of Scientific and Industrial Research (CSIR), Uppal Road, Hyderabad 500 007, India. 192University of Maryland, School of Medicine, Baltimore, Maryland 21201, USA. Funding Information: Study-specific acknowledgements and funding sources for participating studies are reported in Supplementary Note. Zebrafish work was supported by NIH R01DK090311 and R24OD017870 to W.G. Publisher Copyright: © 2016, Nature Publishing Group. All rights reserved.
PY - 2016/1/21
Y1 - 2016/1/21
N2 - Reduced glomerular filtration rate defines chronic kidney disease and is associated with cardiovascular and all-cause mortality. We conducted a meta-analysis of genome-wide association studies for estimated glomerular filtration rate (eGFR), combining data across 133,413 individuals with replication in up to 42,166 individuals. We identify 24 new and confirm 29 previously identified loci. Of these 53 loci, 19 associate with eGFR among individuals with diabetes. Using bioinformatics, we show that identified genes at eGFR loci are enriched for expression in kidney tissues and in pathways relevant for kidney development and transmembrane transporter activity, kidney structure, and regulation of glucose metabolism. Chromatin state mapping and DNase I hypersensitivity analyses across adult tissues demonstrate preferential mapping of associated variants to regulatory regions in kidney but not extra-renal tissues. These findings suggest that genetic determinants of eGFR are mediated largely through direct effects within the kidney and highlight important cell types and biological pathways.
AB - Reduced glomerular filtration rate defines chronic kidney disease and is associated with cardiovascular and all-cause mortality. We conducted a meta-analysis of genome-wide association studies for estimated glomerular filtration rate (eGFR), combining data across 133,413 individuals with replication in up to 42,166 individuals. We identify 24 new and confirm 29 previously identified loci. Of these 53 loci, 19 associate with eGFR among individuals with diabetes. Using bioinformatics, we show that identified genes at eGFR loci are enriched for expression in kidney tissues and in pathways relevant for kidney development and transmembrane transporter activity, kidney structure, and regulation of glucose metabolism. Chromatin state mapping and DNase I hypersensitivity analyses across adult tissues demonstrate preferential mapping of associated variants to regulatory regions in kidney but not extra-renal tissues. These findings suggest that genetic determinants of eGFR are mediated largely through direct effects within the kidney and highlight important cell types and biological pathways.
UR - http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=84957605211&partnerID=8YFLogxK
UR - http://www.scopus.com/inward/citedby.url?scp=84957605211&partnerID=8YFLogxK
U2 - 10.1038/ncomms10023
DO - 10.1038/ncomms10023
M3 - Article
C2 - 26831199
AN - SCOPUS:84957605211
VL - 7
M1 - 10023
ER -